冷冻离心机在高转速运行时的转子体与空气摩擦生热可能导致机身温度不易控制，过高温度还会影响冷冻离心机内部元件的使用寿命。这也就是冷冻离心机和普通冷冻离心机的区别，冷冻离心机使用制冷系统，能够控制温度保护机器元件，普通冷冻离心机是不带制冷系统的。冷冻离心机配有制冷系统，其系统一般包括压缩机、散热器，控制电路。当冷冻离心机腔内温度高于设定温度，控制电路开启压缩机制冷，散热器散热，腔内温度降低，直至低于设定温度，控制电路关闭压缩机散热器。
根据大多数的用户实验要求，必须冷冻离心机配有低温控制系统，比如分离一些有机活性物质：酶，有机易挥发的物质等需要恒温或是温差不超过正负10℃。来保证实验条件满足实验设计需要，确保实验顺利进行。
转子作为冷冻离心机的关键部件，那么其操作和更换的要点是什么?
1.选择与冷冻离心机配套的转子。每种类型的离心机都有一个相匹配的转子。不同类型离心机的转子不能混合。
2.根据转速要求选择合适的转子。每个转子都有自己的高允许转速，不允许超过额定转速。
3.建立转子使用档案。当每个转子都有其高允许使用的累积极限时，应为每个转子建立服务文件，记录其累计使用时间。如果超过了累积极限，转子必须按照规定以减速的速度使用。
4.预冷转子。如果离心温度低于室温，转子应在使用前先在冰箱或离心机转子室中进行预冷。
5.不要使用损坏的转子。使用前应仔细检查转子是否有划痕或腐蚀，使用后的转子必须完好无损。
6.准确地装配转子。转子与轴承固定在一起，防止转子随轴承高速松动，造成转子溅出。
